Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cap1P40124 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cap1P40124 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cap1P40124 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cap1P40124 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cap1P40124 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cap1P40124 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cap1P40124 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cap1P40124 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cap1P40124 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cap1P40124 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cap1P40124 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cap1P40124 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cap1P40124 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms