Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprkP35822 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprkP35822 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprkP35822 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms