Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms