Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6dP35459 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6dP35459 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms