Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2aP35436 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms