Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sftpa1P35242 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sftpa1P35242 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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