Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp4P35123 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp4P35123 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp4P35123 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp4P35123 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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