Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms