Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc5P32043 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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