Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa2P31245 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms