Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd28P31041 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd28P31041 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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