Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms