Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vav1P27870 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms