Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2afxP27661 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afxP27661 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms