Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CftrP26361 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CftrP26361 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CftrP26361 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CftrP26361 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CftrP26361 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CftrP26361 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CftrP26361 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CftrP26361 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CftrP26361 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CftrP26361 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CftrP26361 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CftrP26361 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CftrP26361 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CftrP26361 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CftrP26361 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CftrP26361 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CftrP26361 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CftrP26361 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CftrP26361 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CftrP26361 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CftrP26361 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CftrP26361 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CftrP26361 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CftrP26361 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CftrP26361 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CftrP26361 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CftrP26361 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CftrP26361 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CftrP26361 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CftrP26361 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CftrP26361 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CftrP26361 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CftrP26361 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CftrP26361 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CftrP26361 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CftrP26361 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CftrP26361 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CftrP26361 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CftrP26361 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CftrP26361 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CftrP26361 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CftrP26361 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CftrP26361 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CftrP26361 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CftrP26361 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CftrP26361 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CftrP26361 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CftrP26361 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CftrP26361 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CftrP26361 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CftrP26361 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CftrP26361 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CftrP26361 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CftrP26361 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CftrP26361 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CftrP26361 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CftrP26361 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CftrP26361 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CftrP26361 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CftrP26361 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CftrP26361 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CftrP26361 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CftrP26361 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CftrP26361 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CftrP26361 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CftrP26361 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CftrP26361 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CftrP26361 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CftrP26361 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CftrP26361 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CftrP26361 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CftrP26361 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CftrP26361 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CftrP26361 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CftrP26361 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CftrP26361 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CftrP26361 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CftrP26361 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms