Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChgaP26339 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChgaP26339 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ChgaP26339 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms