Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna1P26231 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms