Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms