Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eif3aP23116 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms