Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms