Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TP20293 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TP20293 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TP20293 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TP20293 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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TP20293 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TP20293 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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TP20293 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TP20293 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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TP20293 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TP20293 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TP20293 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TP20293 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TP20293 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TP20293 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TP20293 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TP20293 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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TP20293 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TP20293 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TP20293 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TP20293 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TP20293 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TP20293 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TP20293 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TP20293 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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