Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfaP20033 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms