Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms