Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Defa-rs1P17533 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defa-rs1P17533 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms