Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrm1P12657 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms