Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcp1P11983 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcp1P11983 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms