Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RaraP11416 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RaraP11416 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RaraP11416 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RaraP11416 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RaraP11416 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RaraP11416 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms