Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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PtprqP0C5E4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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PtprqP0C5E4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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PtprqP0C5E4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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PtprqP0C5E4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PtprqP0C5E4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PtprqP0C5E4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PtprqP0C5E4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PtprqP0C5E4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PtprqP0C5E4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PtprqP0C5E4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PtprqP0C5E4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprqP0C5E4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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