Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb7P09024 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms