Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp1P08042 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms