Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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