Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SparcP07214 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SparcP07214 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SparcP07214 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SparcP07214 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SparcP07214 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms