Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prp2P05143 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms