Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-Eb1P04230 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms