Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms