Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme6O88425 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme6O88425 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nme6O88425 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms