Protein–RNA interactions for Protein: O55022

Pgrmc1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgrmc1O55022 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgrmc1O55022 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgrmc1O55022 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms