Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc3O55013 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms