Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SlkO54988 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlkO54988 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlkO54988 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms