Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CrxO54751 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CrxO54751 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CrxO54751 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CrxO54751 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CrxO54751 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CrxO54751 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CrxO54751 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CrxO54751 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CrxO54751 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CrxO54751 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CrxO54751 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CrxO54751 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CrxO54751 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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