Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Timm44O35857 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Timm44O35857 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Timm44O35857 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Timm44O35857 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timm44O35857 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms