Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf18O35714 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms