Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk2O35491 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk2O35491 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Clk2O35491 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Clk2O35491 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Clk2O35491 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Clk2O35491 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Clk2O35491 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk2O35491 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Clk2O35491 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk2O35491 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Clk2O35491 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clk2O35491 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clk2O35491 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clk2O35491 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clk2O35491 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk2O35491 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clk2O35491 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms