Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms