Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms