Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc1O35379 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms