Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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