Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1aO35134 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms