Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scarb2O35114 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Scarb2O35114 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Scarb2O35114 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Scarb2O35114 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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