Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms